注册外资公司与注册内资公司的区别主要有以下几点：
1. 在税率的设立上，外资企业和内资企业是没有任何区别的，主要的区别在于外资的企业享有所得税的优惠，通常是两免三减半，即外资的企业从盈利年度开始计算，前两年免征企业所得税，后三年减半征收企业所得税，而内资的企业是不能享受上述的优惠，所以造成了外资企业的税收过于优惠。
2. 外商的投资企业和外国企业所得税税率为30％、24％、15％三档，加上地方所得税税率3％，与内资的企业所得税税率基本相同，只是在征税的对象选择方面有所区别。 内资企业所得税实行33％的比例税率，考虑到大部分的利润水平较低的小型企业的利益，税法又规定了两档照顾性的税率，即对年应纳税所得额在10万元（含10万元）以下至的3万元的企业，暂减按27％的税率征收所得税；对年应纳税所得额在3万元（含3万元）以下的企业，暂减按18％的税率征收所得税。
3. 现行内资的企业和外资企业所得税税率均为33%。同时，对一些特殊的区域外资的企业实行24%、15%的优惠税率，对内资微利的企业分别实行27%、18%的二档的照顾税率等等，税率档次多，使不同的类型企业名义税率和实际税负差距较大。
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